提供数据是2010年至2018年期间在Minnesota大学医学中心接受部分或根治性肾切除术治疗的肾肿瘤患者的术前动脉期腹部CT扫描。图像和真实语义标签以匿名NIFTI格式提供，形状为（num_slices, height, width）。其中num_slices对应于轴向视图，并且随着切片索引的增加从上到下移动。在所有情况下，患者在图像采集期间都是仰卧的，因此height-width的起点位于患者的左前部。切片厚度范围为1毫米至5毫米

BIMCV-COVID19+：COVID19患者RX和CT图像的大注释数据集。数据库的第一次迭代包括1380个CX，885个DX和163个CT研究。

实验二插值数据集

MIMIC数据库中包含了多种类型ICU（外科监护室、内科监护室、创伤外科监护室、新生儿监护室、心脏病监护室、心外恢复监护室）。MIMIC－Ⅲ数据集主要包括波形数据集（病人的生命体征趋势图）和临床数据集，按照记录内容的不同，共包含以下21个数据表：住院表、出院表、当前使用医疗服务记录表（CPT）、日期型事件表、医务人员表、监测情况表、ＩＣＤ病情确诊表、诊断相关组编码表（DRG）、ICU记录表、注射记录表（ＣＶ）、注射记录表（ＭＶ）、排泄记录表、化验记录表、微生物检测记录表、文本报告记录表、病人登记表、处方信息表、过程事件表（ＭＶ）、ＩＣＤ手术记录表、服务表、病房转移表。同时，数据集中还包含了５个辅助表用来辅助查找：目前使用医疗服务术语表、ＩＣＤ病情确诊词典表、ＩＣＤ医疗过程词典表、ＩＣＵ化验词典表、门诊化验词典表。

北美放射协会儿童骨龄检测数据集

Retinal Image Database

训练数据集

A Large-Scale Lightweight Benchmark for 2D and 3D Biomedical Image Classification

数据集首页查看更多信息：https://www.synapse.org/#!Synapse:syn3193805/wiki/217790 CT Scans The dataset consists of planning CT scans of cervical cancer patients that were in varying stages of the disease but that were all eligible for radiotherapy. The CT scans consist of between 148 and 241 axial slices (depending on body size) of 512x512 voxels. Voxel resolution was either 1.27x1.27 or 0.977x0.977, both with a slice thickness of 2.5mm. The scans were acquired with a full-bladder drinking protocol, meaning that patients were asked to drink 300 ml of water on hour prior to treatment. Most patients were scanned in prone position using a belly board, but for practical reasons some patients were scanned in supine position (patient numbers 1577656, 1689606, 2609008, 5463446, 5681868, 6770262, 6798630) In all patients, markers were implanted around the cervix but these were not used for patient setup. For most patients four markers were implanted. The standard registration data was generated by ElastiX.

该数据集收集的数据包括25岁至75岁女性的乳房超声图像。这些数据是在2018年收集的。患者人数为600名女性患者。该数据集由780个图像组成，平均图像大小为500 * 500像素。图像采用 PNG 格式。地面真实图像与原始图像一起呈现。图像分为正常、良性和恶性三类。

Sunnybrook_Cardiac数据集，又称2009年心脏MR左心室分割挑战数据，是用于心脏病研究的图片数据集，由来自患者和病理混合的45个电影 - MRI图像组成：健康，肥大，心肌梗塞和心脏衰竭。该数据集于2003年由美国国立卫生研究院发布，相关论文为Normal human left and right ventricular dimensions for MRI as assessed by turbo gradient echo and steady‐state free precession imaging sequences。

EEG brain wave for confusion_For variable selection and causal inference数据集是学生观看视频额叶波动的数据集，旨在判断混乱与否。 发布者收集了10名大学生观看MOOC视频剪辑时的EEG信号数据。其提取的在线教育视频被认为不会让大学生感到困惑，例如引入基本代数或几何学的视频。如果学生不熟悉量子力学和干细胞研究等视频主题，发布者还准备了可能会混淆典型大学生的视频。发布者准备了20个视频，每个类别10个。每个视频大约2分钟，在一个主题的中间切断了两分钟的剪辑，使视频更加混乱。学生们戴着单通道无线MindSet，测量额叶上的活动。MindSet测量放在前额上的电极和每个与耳朵接触的两个电极（一个接地和一个参考）之间的电压。在每次课程结束后，学生将他/她的混淆等级评定为1-7，其中一个对应于最不容易混淆，七个对应最混乱。这些标签如果进一步标准化为学生是否感到困惑的标签。除了预先确定的混淆标签外，此标签还提供自我标记的混淆。

PDB 蛋白质结构数据集，是一个专门收录蛋白质及核酸的三维结构资料的数据库，拥有十分悠久的历史，由美国布鲁克黑文国家实验室的 Walter Hamilton 于 1971 年起开始构建收集。PDB 数据库中信息主要包含：原子坐标，蛋白质结构的其他信息，以及除蛋白以外生物大分子的信息。可以在 PDB 数据库查找核糖体、致癌基因、药物靶标，甚至整个病毒的结构.

结核病图像数据集 带有注释的结核病图像数据集。结核病 (TB) 是一种传染病，通常由结核分枝杆菌 (MTB) 细菌引起。结核病通常会影响肺部，但也会影响身体的其他部位。大多数感染没有症状，在这种情况下，它被称为潜伏性结核病。数据集它包含 928 个痰图像，边界框为 3734 个杆菌。 XML 文件中包含图像的边界框详细信息。

BTCV数据集 由30名腹部CT扫描的受试者组成，其中13个器官在V anderbilt大学医学中心临床放射科医生的监督下由译员注释。 每次CT扫描均在门静脉期进行对比增强，由80至225层组成，512×512像素，层厚为1至6mm。

该数据集来自VESSEL12挑战，其目的是比较从健康和患病人群的胸部计算机断层扫描中对肺血管进行（半）自动分割的方法。扫描来自各种来源，代表了各种临床上常见的扫描仪和协议。选择扫描，使得在大约一半的扫描中使用造影剂。大约一半的扫描包含肺气肿，结节或肺栓塞等异常情况。当前的最大切片间距为1毫米，大多数扫描（各向同性）。

PROMISE12数据集用于MICCAI 2012前列腺分割挑战赛。使用多个MRI供应商和扫描协议在不同地点获取了50名患有各种疾病的患者的磁共振（MR）图像（T2加权）。

BWH MRI Prostate data. 10 datasets, including a derived segmentation series with labelmaps.

Prostate158 是一个双参数 3T 前列腺 MRI 图像的精选数据集，用于解剖区域和癌变的自动分割。组织病理学确认可用于每个癌性病变。所有研究都包括带有表观扩散系数 （ADC） 图的 T2 加权 （T2W） 和扩散加权 （DWI） 图像。对每项研究中的图像进行重新采样，以使方向、方向和间距相同。

前列腺超声数据集

实验专属

蒙哥马利市收集的肺结核胸透数据集，包含80张正常的扫描和58张不正常的扫描。

QIN_lung_CT肺癌 CT 影像数据集，其包含 47 个病人的 3954 张图像，分为 47 个系列共计 47 项研究。

STARE是一个在眼底照片中对多种眼科疾病进行诊断的数据集。

共841张图片，对37333个细胞核进行了标注。分割数据集。

胸部X光分割数据（肺部和心脏标签），一共有101张胸片，101个nii格式的标签数据，标签数据中2是肺部，3是心脏，0是背景。（数据来源：https://www.kaggle.com/c/siim-acr-pneumothorax-segmentation 中的部分胸部正位片。然后进行肺部和心脏标注。因为没有经过二次医生审核，标记数据会有偏差）

2d_lung_seg

feature_se

preprocessed

该数据集是是在没有内部或外部噪音的受控环境下从人脑收集的八通道EEG原始数据。这些数据是从伊斯兰堡COMSATS大学收集的，数据采集人员的组成包括九成的学生和一成的教师组成。对于其中的任一单项实验，有两组数据。第一组数据是在受试者睁眼时采集的，第二组数据是在受试者闭眼时采集的。收集数据的硬件是CYTON公司的8-通道脑电采集设备。